Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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COPS9Q8WXC6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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COPS9Q8WXC6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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