Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
TRIM41Q8WV44 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TRIM41Q8WV44 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms