Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF4Q8WV16 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms