Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MCOLN3Q8TDD5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms