Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL22A1Q8NFW1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL22A1Q8NFW1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms