Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARMIL3Q8ND23 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms