Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCSAMQ8N6F7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GCSAMQ8N6F7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms