Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGSF1Q8N6C5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGSF1Q8N6C5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms