Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2BQ8N4Y2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRACR2BQ8N4Y2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRACR2BQ8N4Y2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms