Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM139Q8IV31 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM139Q8IV31 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms