Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BRAPQ7Z569 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRAPQ7Z569 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms