Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HS2ST1Q7LGA3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms