Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
BEND4Q6ZU67 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms