Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CFAP47Q6ZTR5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CFAP47Q6ZTR5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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