Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC129Q6ZRS4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC129Q6ZRS4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms