Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATRAIDQ6UW56 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATRAIDQ6UW56 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms