Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC62Q6P9F0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC62Q6P9F0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms