Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LETMD1Q6P1Q0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LETMD1Q6P1Q0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms