Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RWDD4Q6NW29 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RWDD4Q6NW29 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RWDD4Q6NW29 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RWDD4Q6NW29 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RWDD4Q6NW29 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RWDD4Q6NW29 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RWDD4Q6NW29 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms