Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3HQ6NTF7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3HQ6NTF7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms