Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRNP1Q6NT89 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms