Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HMBOX1Q6NT76 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HMBOX1Q6NT76 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms