Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATL3Q6DD88 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATL3Q6DD88 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms