Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INTS3Q68E01 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms