Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USPL1Q5W0Q7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USPL1Q5W0Q7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms