Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
CHIC1Q5VXU3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CHIC1Q5VXU3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms