Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SUSD4Q5VX71 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SUSD4Q5VX71 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms