Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC30Q5VVM6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC30Q5VVM6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms