Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SOGA3Q5TF21 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOGA3Q5TF21 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms