Protein–RNA interactions for Protein: Q5T8R8

C9orf66, Uncharacterized protein C9orf66, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf66Q5T8R8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf66Q5T8R8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms