Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM78Q5T7P6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM78Q5T7P6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms