Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BEND3Q5T5X7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEND3Q5T5X7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms