Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC183Q5T5S1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC183Q5T5S1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms