Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C1orf220Q5T0J3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms