Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM47AQ5JRC9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM47AQ5JRC9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms