Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HERC4Q5GLZ8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HERC4Q5GLZ8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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