Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ODF2Q5BJF6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODF2Q5BJF6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms