Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC93Q567U6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC93Q567U6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms