Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZC2HC1CQ53FD0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZC2HC1CQ53FD0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms