Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP100Q494V2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CFAP100Q494V2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
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