Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KRTAP21-3Q3LHN1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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