Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HFEQ30201 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HFEQ30201 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HFEQ30201 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HFEQ30201 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms