Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A8Q2Y0W8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms