Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SPHKAPQ2M3C7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPHKAPQ2M3C7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms