Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RTL8BQ17RB0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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RTL8BQ17RB0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RTL8BQ17RB0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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