Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TXNRD1Q16881 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TXNRD1Q16881 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms