Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ECM1Q16610 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM1Q16610 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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