Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPE65Q16518 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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