Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABRA6Q16445 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GABRA6Q16445 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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