Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SF3A1Q15459 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SF3A1Q15459 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
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